Stjepan Mesić trebao je još 16. svibnja 1991. automatski postati predsjednik Predsjedništva SFRJ, ali je srpski član Borisav Jović zatražio glasovanje. Rezultat glasovanja bio je neriješen (4:4), jer su Srbija, Vojvodina, Kosovo i Crna Gora glasale protiv Mesića. Presudio je bosanski Srbin Bogić Bogićević koji je dao glas Stjepanu Mesiću, iako je bio pod velikim pritiskom komunista iz Srbije da mu uskrati glas.
Tek nakon pritiska europske diplomacije, na današnji je dan Stjepan Mesić konačno izabran za posljednjeg predsjednika u povijesti SFRJ.
Tako je Stjepan Mesić igrom sudbine postao posljednji predsjednik Jugoslavije, položaja kojeg je do smrti držao diktator Josip Broz Tito. Dok danas Josipu Brozu bivši predsjednik Jugoslavije i Hrvatske Stjepan Mesić drži i govori hvalospjeve, u to vrijeme Stjepan Mesić ga se itekako odricao, kao i cijelog komunističkog sustava. Vremenom, Mesić se kao bivši član Saveza komunista i komunistički zastupnik u Saboru još 60-ih, umnogome vratio na početne pozicije kojih se vjerojatno nikada nije zaista ni odrekao.
Za tu službu predsjednika Jugoslavije Mesić i danas dobiva iz Srbije mirovinu.
Nedavno je 82-godišnji Mesić, nakon ukidanja njegovog ureda bivšeg predsjednika, najavio povratak u aktivnu politiku.